mRNA测序

 

产品简介

 

转录组测序是通过高通量测序技术全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，包括编码RNA和非编码RNA，结合生物信息技术获得RNA的表达和调控信息，检测多种RNA的表达和变化，同时建立不同类型的非编码RNA与mRNA之间的调控关系，探索RNA之间的相互作用，构建潜在的RNA调控网络，系统的揭示生物现象背后RNA世界的转录调控规律。

 

 

技术路线图

 

 

 

结果展示

 

 

基因表达量小提琴图（左）； 样本相关性图（中）； 差异表达基因火山图（右）

 

差异基因在染色体上的分布图（左）； 差异表达模式聚类图（中）； circRNA-miRNA-mRNA网络图（右）

 

 

送样要求

 

 

应用方向

 

 

应用案例

 

 

全转录组测序和蛋白组共同揭示心力衰竭关键表达分子和蛋白靶点

Fibroblast-specific proteotranscriptomes reveal distinct fibrotic signatures of human sinoatrial node in nonfailing and failing hearts

发表杂志：Circulation（IF: 29.690）； 发表时间： 2021年 7月； 应用技术： 全转录组测序

 

本研究采用从右心房和窦房结分离的成纤维细胞，经体外培养后进行全转录组测序和定量蛋白组，绘制包括信使RNA、非编码RNA（lncRNA和miRNA）和蛋白质在内的全面转录-蛋白组表达图谱。全转录组测序分析，发现正常心脏和衰竭心脏中窦房结组织成纤维细胞的mRNA整体表达模式相似，表明二者有共同的信号通路和分子机制。正常心脏窦房结和右心房分离培养的成纤维细胞具有样本特异性的差异。另外，本研究还是首次记录人类窦房结组织成纤维细胞所特有的长链非编码lncRNA。在加入TGF-β的组别比较中，miRNA在正常心脏和衰竭心脏中窦房结组织中呈现出明显差别的表达模式。这项研究通过分子和蛋白质靶点综合图谱，建立人心脏窦房结成纤维细胞蛋白-全转录组数据库。这些数据可用于识别分子和蛋白质的特征、信号通路，以及心衰患者窦房结纤维化和心律失常的潜在治疗靶点。

 

窦房结成纤维细胞全转录组表达谱组成（左）； 促纤维化相关的差异表达的mRNA基因（右）

lncRNA差异表达层次聚类热图分析（左）； miRNA表达差异表达层次聚类热图（右）